客户案例

人类基因组序列中心采用Force10网络推动疾病研究领域发展

    1996年，贝勒医学院（德克萨斯修斯顿）为六个参选试点的学院之一，支持人类基因项目的最后攻关阶段。
    1999年，贝勒医学院从三选一中胜出完成这一最后攻关阶段。
    基因组是生命最基本的信息载体，在由3亿多的碱基构成的核酸链上，记载了生命活动
需要的所有遗传信息。预计需要15年来准确测序。但是，新技术的应用使工作效率提高了
30多倍，测序工作足足缩短了两年时间。
    就其本身而言，贝勒人类基因组测序中心（ HGSC ）全天侯运行77套测序设备。相同的DNA序列，在1998年花了一个月完成，现在一天就能完成。贝勒人类基因组测序中心的每日数据流量都是海量的，最重要的是测序要达到99%的准确性。为了满足研究人员之间、超型计算机和具有线速、无阻塞性能、可靠性且低成本的存储设施之间的数据传输，贝勒人类基因组测序中心安装了Force10 Networks TeraScale E1200交换机/路由器。

花式网络不符合我们的要求

    有许多深奥的技术参与了基因组测序，但产生的数据包是不同步的，如那些流动视频或声音。“坦率地说，我们需要有韧劲十足、高吞吐量的网络，”HGSC系统经理大卫帕克说。 “我们的目标是尽可能用少量高度熟练的研究人员来满足严格的时间目标，”他解释说， “并且还应节省成本。 ”
    为达到这些目标，贝勒人类基因组测序中心需要一个网络，可以无阻塞、全线速传输数据。它需具有可扩展性，允许程序扩展。而且，它有令人印象深刻的性价比。 “竟争终将靠实力取胜 ”帕克笑着说。 “我们成为这三个阶段中心的一个，因为我们既具竟争力，成本又低。我们的网络基础设施发挥了重要作用， ”他补充说。

    凭借Force10 E1200， HGSC得到其所需要的灵活性、可扩展性和强劲性。 “我们的扩展能力要求有线速、无阻塞核心交换基础设施，可快速移动设置于网络计算结构内外的大型数据， ”帕克说。 “一对E1200s就给了我们那些，且没有压力。 ”它灵活地混合了万兆以太网和千兆以太网线路卡，以满足任何负载平衡可能超长时间出现的需求。
    此外， Force10 E-Series提供了可扩展性，使中心扩大其网络从100节点到300节点 ，甚至扩展到未来的1000点。

 

 

不只用于基因组的工作

     人类3号染色体测序于2006年完成后，人类基因组测序中心又完成了其多年测序人类基因组的最后阶段。研究人员目前正在利用基因组信息和由中心保留的超型计算机来寻找人类疾病的遗传基础。
    Force10的这种网络性能能被应用于其他方面的研究，如药品和复杂器官的研究。
    例如，基因研究的一个重要方面是查明那些是遗传因子的部分。基因是蛋白质的直接产品，蛋白质确定我们的遗传质量。“而且蛋白质，本身是一个巨大的研究机会，”帕克说。
    “理论上说，蛋白质折叠对于设计药物是很关键的，其不必进行大量的试验。”蛋白质折叠是指蛋白质形成后被展开的三维形状，使他们能够履行其正常功能。
    另一个导致其本身产生大量数据和数据共享的研究领域是神经建模。“在试图了解我们的大脑如何工作时，我们需要更好地了解神经元是如何工作的，大脑哪些领域参与哪些职能，”帕克说。“在某些方面建模所有可能的组合使得测序300亿碱基对看起来很轻松。”
    但是，他补充说，蛋白质折叠与神经建模研究都是高度协作的、数据密集型的努力。“他们产生大量的二进制数据，这些数据若在数据库和研究人员之间传动，需有更大的可靠性和稳定性。一个无阻塞、线速的网络将是更适合的，”他总结道。

 

展望未来

    随着解码工作最后阶段完成，HGSC通过研究，对疾病和治疗方法取得了更深入地了解。 Force10 E-Series提供HGSC所需的高性能网络，继续扩大科学研究的领域。

 

 

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